Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGM1P36871 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGM1P36871 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGM1P36871 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGM1P36871 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGM1P36871 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGM1P36871 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGM1P36871 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM1P36871 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM1P36871 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGM1P36871 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM1P36871 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM1P36871 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM1P36871 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PGM1P36871 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM1P36871 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM1P36871 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGM1P36871 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGM1P36871 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PGM1P36871 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PGM1P36871 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGM1P36871 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGM1P36871 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PGM1P36871 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PGM1P36871 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM1P36871 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM1P36871 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PGM1P36871 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM1P36871 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM1P36871 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PGM1P36871 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM1P36871 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM1P36871 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PGM1P36871 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM1P36871 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM1P36871 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PGM1P36871 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM1P36871 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM1P36871 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM1P36871 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PGM1P36871 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PGM1P36871 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM1P36871 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PGM1P36871 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM1P36871 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM1P36871 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM1P36871 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PGM1P36871 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM1P36871 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PGM1P36871 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM1P36871 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM1P36871 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGM1P36871 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGM1P36871 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGM1P36871 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM1P36871 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM1P36871 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGM1P36871 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM1P36871 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM1P36871 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM1P36871 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM1P36871 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGM1P36871 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGM1P36871 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM1P36871 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM1P36871 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGM1P36871 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM1P36871 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM1P36871 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM1P36871 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGM1P36871 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM1P36871 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGM1P36871 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM1P36871 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM1P36871 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGM1P36871 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms