Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDRP35968 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDRP35968 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDRP35968 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDRP35968 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDRP35968 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
KDRP35968 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDRP35968 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDRP35968 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDRP35968 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KDRP35968 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDRP35968 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KDRP35968 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KDRP35968 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KDRP35968 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
KDRP35968 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDRP35968 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
KDRP35968 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
KDRP35968 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
KDRP35968 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDRP35968 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDRP35968 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
KDRP35968 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KDRP35968 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
KDRP35968 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
KDRP35968 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDRP35968 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDRP35968 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDRP35968 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
KDRP35968 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDRP35968 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDRP35968 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
KDRP35968 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDRP35968 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDRP35968 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KDRP35968 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
KDRP35968 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDRP35968 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
KDRP35968 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
KDRP35968 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
KDRP35968 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDRP35968 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
KDRP35968 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KDRP35968 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDRP35968 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
KDRP35968 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDRP35968 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDRP35968 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDRP35968 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
KDRP35968 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDRP35968 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDRP35968 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDRP35968 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDRP35968 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDRP35968 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDRP35968 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDRP35968 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDRP35968 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDRP35968 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDRP35968 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDRP35968 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDRP35968 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDRP35968 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDRP35968 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDRP35968 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDRP35968 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDRP35968 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDRP35968 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDRP35968 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDRP35968 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDRP35968 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDRP35968 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDRP35968 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDRP35968 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDRP35968 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDRP35968 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
KDRP35968 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDRP35968 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDRP35968 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDRP35968 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDRP35968 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDRP35968 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDRP35968 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
KDRP35968 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDRP35968 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDRP35968 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDRP35968 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDRP35968 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDRP35968 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDRP35968 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDRP35968 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDRP35968 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDRP35968 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDRP35968 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
KDRP35968 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms