Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPA3P35244 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPA3P35244 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPA3P35244 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPA3P35244 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPA3P35244 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPA3P35244 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPA3P35244 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPA3P35244 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPA3P35244 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPA3P35244 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPA3P35244 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPA3P35244 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPA3P35244 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPA3P35244 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPA3P35244 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPA3P35244 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RPA3P35244 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPA3P35244 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPA3P35244 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPA3P35244 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA3P35244 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA3P35244 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPA3P35244 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA3P35244 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPA3P35244 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RPA3P35244 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA3P35244 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPA3P35244 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPA3P35244 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPA3P35244 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPA3P35244 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RPA3P35244 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA3P35244 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA3P35244 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPA3P35244 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA3P35244 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA3P35244 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA3P35244 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA3P35244 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPA3P35244 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA3P35244 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA3P35244 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA3P35244 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RPA3P35244 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA3P35244 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPA3P35244 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPA3P35244 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA3P35244 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RPA3P35244 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA3P35244 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA3P35244 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RPA3P35244 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RPA3P35244 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA3P35244 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA3P35244 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA3P35244 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA3P35244 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RPA3P35244 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA3P35244 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA3P35244 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA3P35244 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA3P35244 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPA3P35244 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPA3P35244 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA3P35244 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA3P35244 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RPA3P35244 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPA3P35244 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA3P35244 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA3P35244 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA3P35244 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPA3P35244 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA3P35244 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPA3P35244 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms