Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB6P28072 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB6P28072 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB6P28072 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB6P28072 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB6P28072 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB6P28072 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB6P28072 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB6P28072 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB6P28072 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB6P28072 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB6P28072 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB6P28072 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB6P28072 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms