Protein–RNA interactions for Protein: P25440

BRD2, Bromodomain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD2P25440 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD2P25440 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD2P25440 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRD2P25440 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD2P25440 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD2P25440 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD2P25440 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD2P25440 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BRD2P25440 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BRD2P25440 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD2P25440 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BRD2P25440 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD2P25440 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD2P25440 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BRD2P25440 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD2P25440 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BRD2P25440 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD2P25440 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD2P25440 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD2P25440 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BRD2P25440 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD2P25440 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD2P25440 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BRD2P25440 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD2P25440 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD2P25440 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD2P25440 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BRD2P25440 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD2P25440 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BRD2P25440 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD2P25440 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BRD2P25440 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD2P25440 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD2P25440 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BRD2P25440 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD2P25440 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD2P25440 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD2P25440 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD2P25440 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BRD2P25440 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD2P25440 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD2P25440 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BRD2P25440 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BRD2P25440 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BRD2P25440 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD2P25440 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD2P25440 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD2P25440 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD2P25440 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD2P25440 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD2P25440 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD2P25440 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD2P25440 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD2P25440 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD2P25440 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD2P25440 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD2P25440 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD2P25440 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD2P25440 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD2P25440 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD2P25440 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD2P25440 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD2P25440 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD2P25440 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD2P25440 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD2P25440 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD2P25440 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD2P25440 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD2P25440 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD2P25440 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD2P25440 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD2P25440 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD2P25440 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD2P25440 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD2P25440 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD2P25440 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD2P25440 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD2P25440 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD2P25440 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD2P25440 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRD2P25440 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD2P25440 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRD2P25440 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD2P25440 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD2P25440 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD2P25440 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRD2P25440 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD2P25440 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD2P25440 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
BRD2P25440 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms