Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAX3P23760 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAX3P23760 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAX3P23760 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAX3P23760 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAX3P23760 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAX3P23760 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAX3P23760 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAX3P23760 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAX3P23760 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAX3P23760 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAX3P23760 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PAX3P23760 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAX3P23760 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAX3P23760 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAX3P23760 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAX3P23760 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAX3P23760 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAX3P23760 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAX3P23760 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAX3P23760 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAX3P23760 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAX3P23760 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PAX3P23760 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PAX3P23760 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAX3P23760 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PAX3P23760 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAX3P23760 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAX3P23760 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAX3P23760 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAX3P23760 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PAX3P23760 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAX3P23760 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAX3P23760 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PAX3P23760 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAX3P23760 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAX3P23760 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PAX3P23760 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAX3P23760 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAX3P23760 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PAX3P23760 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAX3P23760 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAX3P23760 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PAX3P23760 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PAX3P23760 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX3P23760 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX3P23760 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX3P23760 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PAX3P23760 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PAX3P23760 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAX3P23760 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAX3P23760 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PAX3P23760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PAX3P23760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAX3P23760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAX3P23760 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAX3P23760 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PAX3P23760 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX3P23760 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX3P23760 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX3P23760 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX3P23760 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAX3P23760 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PAX3P23760 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PAX3P23760 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAX3P23760 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PAX3P23760 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PAX3P23760 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAX3P23760 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PAX3P23760 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PAX3P23760 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAX3P23760 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PAX3P23760 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PAX3P23760 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PAX3P23760 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PAX3P23760 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAX3P23760 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAX3P23760 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAX3P23760 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PAX3P23760 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PAX3P23760 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PAX3P23760 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms