Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN3P20807 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN3P20807 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN3P20807 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN3P20807 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN3P20807 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms