Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HLA-DPA1P20036 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HLA-DPA1P20036 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HLA-DPA1P20036 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HLA-DPA1P20036 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HLA-DPA1P20036 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms