Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TCF3P15923 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF3P15923 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCF3P15923 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF3P15923 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF3P15923 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF3P15923 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF3P15923 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF3P15923 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF3P15923 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCF3P15923 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCF3P15923 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCF3P15923 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF3P15923 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF3P15923 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF3P15923 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF3P15923 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF3P15923 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF3P15923 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF3P15923 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF3P15923 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF3P15923 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF3P15923 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF3P15923 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF3P15923 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCF3P15923 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF3P15923 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF3P15923 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF3P15923 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TCF3P15923 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF3P15923 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF3P15923 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF3P15923 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TCF3P15923 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF3P15923 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF3P15923 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF3P15923 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF3P15923 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF3P15923 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF3P15923 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TCF3P15923 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF3P15923 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF3P15923 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCF3P15923 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF3P15923 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF3P15923 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF3P15923 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF3P15923 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF3P15923 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF3P15923 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF3P15923 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF3P15923 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF3P15923 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF3P15923 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF3P15923 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF3P15923 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF3P15923 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF3P15923 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF3P15923 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCF3P15923 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF3P15923 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF3P15923 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF3P15923 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF3P15923 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF3P15923 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF3P15923 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF3P15923 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF3P15923 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF3P15923 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF3P15923 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF3P15923 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF3P15923 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF3P15923 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms