Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRPBP14678 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNRPBP14678 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNRPBP14678 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SNRPBP14678 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNRPBP14678 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms