Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RGPD1P0DJD0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RGPD1P0DJD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RGPD1P0DJD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RGPD1P0DJD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RGPD1P0DJD0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
RGPD1P0DJD0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms