Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
COL1A2P08123 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COL1A2P08123 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
COL1A2P08123 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COL1A2P08123 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
COL1A2P08123 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL1A2P08123 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms