Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI1O95970 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI1O95970 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI1O95970 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI1O95970 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI1O95970 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI1O95970 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGI1O95970 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGI1O95970 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LGI1O95970 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI1O95970 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LGI1O95970 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI1O95970 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI1O95970 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI1O95970 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI1O95970 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LGI1O95970 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI1O95970 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI1O95970 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI1O95970 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI1O95970 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGI1O95970 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGI1O95970 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI1O95970 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI1O95970 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI1O95970 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI1O95970 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGI1O95970 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGI1O95970 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LGI1O95970 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI1O95970 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI1O95970 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI1O95970 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGI1O95970 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI1O95970 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGI1O95970 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGI1O95970 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI1O95970 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI1O95970 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI1O95970 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI1O95970 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGI1O95970 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGI1O95970 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGI1O95970 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGI1O95970 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGI1O95970 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGI1O95970 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI1O95970 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI1O95970 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGI1O95970 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGI1O95970 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LGI1O95970 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGI1O95970 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGI1O95970 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGI1O95970 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI1O95970 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI1O95970 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI1O95970 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGI1O95970 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms