Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCN2BO60939 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN2BO60939 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN2BO60939 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCN2BO60939 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCN2BO60939 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCN2BO60939 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms