Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
SYNJ1O43426 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.55■■■■■ 4.72
SYNJ1O43426 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SYNJ1O43426 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SYNJ1O43426 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SYNJ1O43426 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
SYNJ1O43426 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
SYNJ1O43426 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.32■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
SYNJ1O43426 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.27■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.26■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SYNJ1O43426 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SYNJ1O43426 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SYNJ1O43426 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
SYNJ1O43426 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SYNJ1O43426 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SYNJ1O43426 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.14■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
SYNJ1O43426 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.11■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
SYNJ1O43426 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.06■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
SYNJ1O43426 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
SYNJ1O43426 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms