Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF208O43345 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF208O43345 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF208O43345 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF208O43345 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF208O43345 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms