Protein–RNA interactions for Protein: O15266

SHOX, Short stature homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOXO15266 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOXO15266 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOXO15266 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOXO15266 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHOXO15266 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHOXO15266 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOXO15266 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOXO15266 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHOXO15266 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOXO15266 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHOXO15266 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOXO15266 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOXO15266 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHOXO15266 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHOXO15266 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHOXO15266 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHOXO15266 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHOXO15266 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHOXO15266 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHOXO15266 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHOXO15266 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHOXO15266 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHOXO15266 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHOXO15266 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHOXO15266 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHOXO15266 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHOXO15266 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHOXO15266 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHOXO15266 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHOXO15266 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHOXO15266 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOXO15266 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOXO15266 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOXO15266 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOXO15266 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOXO15266 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOXO15266 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOXO15266 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOXO15266 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOXO15266 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOXO15266 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOXO15266 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOXO15266 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOXO15266 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOXO15266 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOXO15266 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOXO15266 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHOXO15266 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHOXO15266 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOXO15266 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOXO15266 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOXO15266 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHOXO15266 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOXO15266 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOXO15266 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOXO15266 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SHOXO15266 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOXO15266 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOXO15266 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOXO15266 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOXO15266 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHOXO15266 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SHOXO15266 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SHOXO15266 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOXO15266 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOXO15266 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOXO15266 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHOXO15266 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOXO15266 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOXO15266 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOXO15266 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOXO15266 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHOXO15266 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHOXO15266 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHOXO15266 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms