Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC1BO15143 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC1BO15143 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC1BO15143 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC1BO15143 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC1BO15143 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms