Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.46■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.08■■■■□ 3.85
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms