Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4DXG7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
B4DXG7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
B4DXG7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
B4DXG7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4DXG7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4DXG7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4DXG7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4DXG7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
B4DXG7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4DXG7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4DXG7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
B4DXG7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DXG7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DXG7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DXG7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
B4DXG7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
B4DXG7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
B4DXG7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DXG7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DXG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
B4DXG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DXG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DXG7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DXG7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DXG7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
B4DXG7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DXG7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
B4DXG7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DXG7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DXG7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DXG7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
B4DXG7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DXG7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DXG7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
B4DXG7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DXG7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DXG7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DXG7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
B4DXG7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DXG7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DXG7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
B4DXG7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DXG7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
B4DXG7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
B4DXG7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DXG7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DXG7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DXG7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DXG7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
B4DXG7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DXG7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DXG7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DXG7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
B4DXG7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
B4DXG7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DXG7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
B4DXG7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
B4DXG7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DXG7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DXG7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
B4DXG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DXG7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DXG7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DXG7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
B4DXG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DXG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DXG7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DXG7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
B4DXG7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DXG7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DXG7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DXG7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DXG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
B4DXG7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms