Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
A6NNZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
A6NNZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A6NNZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
A6NNZ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
A6NNZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
A6NNZ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
A6NNZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A6NNZ2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A6NNZ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A6NNZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A6NNZ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A6NNZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A6NNZ2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A6NNZ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A6NNZ2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
A6NNZ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A6NNZ2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A6NNZ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A6NNZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A6NNZ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A6NNZ2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
A6NNZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A6NNZ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A6NNZ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A6NNZ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A6NNZ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A6NNZ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A6NNZ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
A6NNZ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A6NNZ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NNZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NNZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NNZ2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A6NNZ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A6NNZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A6NNZ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A6NNZ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A6NNZ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A6NNZ2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A6NNZ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NNZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NNZ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NNZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
A6NNZ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A6NNZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A6NNZ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A6NNZ2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
A6NNZ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
A6NNZ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A6NNZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A6NNZ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
A6NNZ2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
A6NNZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
A6NNZ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
A6NNZ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
A6NNZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
A6NNZ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A6NNZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A6NNZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
A6NNZ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A6NNZ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
A6NNZ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
A6NNZ2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
A6NNZ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
A6NNZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A6NNZ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A6NNZ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
A6NNZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
A6NNZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A6NNZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
A6NNZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
A6NNZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
A6NNZ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A6NNZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
A6NNZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A6NNZ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
A6NNZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
A6NNZ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
A6NNZ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms