Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCCD1A6NED2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCCD1A6NED2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RCCD1A6NED2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RCCD1A6NED2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RCCD1A6NED2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms