Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV2A0A0J9YWF9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRBV2A0A0J9YWF9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRBV2A0A0J9YWF9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV2A0A0J9YWF9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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