Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SMIM3Q9BZL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms