Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
RETNLBQ9BQ08 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms