Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KLHL22Q53GT1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL22Q53GT1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms