Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UPP1Q16831 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPP1Q16831 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UPP1Q16831 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UPP1Q16831 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1
UPP1Q16831 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UPP1Q16831 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UPP1Q16831 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UPP1Q16831 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
UPP1Q16831 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UPP1Q16831 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms