Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTF1Q16619 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CTF1Q16619 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms