Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 GS1-600G8.3-201ENST00000431486 2249 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.084e-10■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ALB-206ENST00000484992 693 ntTSL 23.44□□□□□ -1.861e-11■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 220.69■□□□□ 0.94e-9■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 517.72■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ESRP2-204ENST00000562724 478 ntTSL 317.1■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ESRP2-212ENST00000569964 572 ntTSL 316.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 34.7
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SF3B4Q15427 ESRP2-206ENST00000563159 716 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ESRP2-203ENST00000562567 1379 ntTSL 413.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ESRP2-208ENST00000564465 734 ntTSL 310.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 34.7
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SF3B4Q15427 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 VILL-209ENST00000486616 4439 ntTSL 213.46□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 34.7
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SF3B4Q15427 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 54.1□□□□□ -1.757e-8■■■■■ 34.7
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SF3B4Q15427 CAP1-218ENST00000479759 888 ntTSL 53.08□□□□□ -1.924e-6■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ETV4-207ENST00000586764 581 ntTSL 314.4□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 ETV4-209ENST00000587151 582 ntTSL 512.81□□□□□ -0.365e-7■■■■■ 34.7
SF3B4Q15427 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-215ENST00000474353 2906 ntTSL 28.64□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-201ENST00000277982 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.031e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 FAM199X-201ENST00000299906 2237 ntTSL 1 (best)8.58□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-204ENST00000361941 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-211ENST00000371247 7354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-208ENST00000371241 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 34.6
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SF3B4Q15427 DCXR-204ENST00000577712 429 ntTSL 514.09□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 34.6
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SF3B4Q15427 AURKB-211ENST00000583915 397 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 34.6
SF3B4Q15427 ABHD5-201ENST00000013894 833 ntTSL 316.77■□□□□ 0.281e-10■■■■■ 34.6
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SF3B4Q15427 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 32.5□□□□□ -2.019e-7■■■■■ 34.5
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SF3B4Q15427 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 34.5
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SF3B4Q15427 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 34.5
SF3B4Q15427 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 34.5
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SF3B4Q15427 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 34.5
SF3B4Q15427 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 34.5
SF3B4Q15427 MUS81-213ENST00000530928 1793 ntTSL 217.04■□□□□ 0.325e-7■■■■■ 34.5
SF3B4Q15427 GRK6-205ENST00000506296 955 ntTSL 516.2■□□□□ 0.184e-7■■■■■ 34.5
SF3B4Q15427 EP400-208ENST00000611841 3129 ntTSL 511.56□□□□□ -0.565e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 PRRC2A-213ENST00000487839 1071 ntTSL 58.86□□□□□ -0.996e-10■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ITGB1-217ENST00000494395 562 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 ITGB1-214ENST00000488427 861 ntTSL 1 (best)4.34□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.595e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.625e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-213ENST00000580320 915 ntTSL 219.88■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-206ENST00000578273 877 ntTSL 519.57■□□□□ 0.723e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-210ENST00000579334 1251 ntTSL 519.37■□□□□ 0.693e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-207ENST00000578885 968 ntTSL 519.24■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.633e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-214ENST00000580750 1076 ntTSL 518.86■□□□□ 0.613e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-218ENST00000582900 676 ntTSL 318.36■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-212ENST00000579842 715 ntTSL 318.36■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-215ENST00000581584 766 ntTSL 317.83■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-211ENST00000579821 452 ntTSL 311.69□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-216ENST00000582074 631 ntTSL 310.22□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DCXR-203ENST00000577532 573 ntTSL 37.43□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.767e-8■■■■■ 34.4
SF3B4Q15427 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 518.63■□□□□ 0.572e-9■■■■■ 34.4
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