Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.48e-8■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-204ENST00000465180 2060 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.665e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-208ENST00000482651 966 ntTSL 310.78□□□□□ -0.685e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.483e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 315.71■□□□□ 0.118e-9■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 CTNND1-217ENST00000527599 572 ntTSL 26.68□□□□□ -1.341e-11■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 224.92■■□□□ 1.584e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 ACAA2-206ENST00000589432 1840 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.921e-6■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 SPTAN1-204ENST00000461855 857 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-7■■□□□ 12.2
G3BP1Q13283 MACF1-213ENST00000469490 842 ntTSL 55.92□□□□□ -1.461e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SEPT2-237ENST00000481500 756 ntTSL 28.65□□□□□ -1.029e-10■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.591e-323■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 224.85■■□□□ 1.575e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 GORASP2-207ENST00000486498 2096 ntTSL 216.37■□□□□ 0.212e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-21■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-21■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 STAU1-208ENST00000437404 1085 ntTSL 1 (best)25.39■■□□□ 1.662e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 RRP1B-202ENST00000470886 4634 ntTSL 212.71□□□□□ -0.373e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HIF1A-203ENST00000394997 3922 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HIF1A-202ENST00000337138 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.863e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.113e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.223e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.643e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.193e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PFKL-207ENST00000474114 6007 ntTSL 1 (best)22.07■■□□□ 1.121e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SON-205ENST00000421541 1151 ntTSL 1 (best)6.2□□□□□ -1.427e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.233e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MTDH-202ENST00000519293 629 ntTSL 36.33□□□□□ -1.43e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MTDH-204ENST00000521933 565 ntTSL 56.1□□□□□ -1.433e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HNRNPU-210ENST00000483966 1069 ntTSL 24.45□□□□□ -1.79e-10■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 MTDH-205ENST00000522104 486 ntTSL 24.24□□□□□ -1.733e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 CAPRIN1-215ENST00000533657 2774 ntTSL 212.65□□□□□ -0.382e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ADH5-209ENST00000512604 331 ntTSL 35.3□□□□□ -1.563e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.941e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ATP5A1-206ENST00000587902 571 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.114e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.724e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.414e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.084e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 TNRC18-208ENST00000455076 577 ntTSL 225.24■■□□□ 1.639e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 HDGF-207ENST00000477306 686 ntTSL 217.84■□□□□ 0.452e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 426.92■■□□□ 1.91e-28■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ACTB-211ENST00000480301 657 ntTSL 1 (best)25.98■■□□□ 1.751e-28■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 419.48■□□□□ 0.711e-28■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 CCT5-212ENST00000514674 568 ntTSL 25.44□□□□□ -1.548e-7■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 DHX38-214ENST00000579387 2258 ntTSL 520.99■□□□□ 0.951e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.634e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.824e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 PRMT1-215ENST00000530070 525 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.661e-8■■□□□ 12.1
G3BP1Q13283 ALDOA-208ENST00000562679 906 ntTSL 517.88■□□□□ 0.452e-27■■□□□ 12
G3BP1Q13283 GREB1-209ENST00000472040 571 ntTSL 518.18■□□□□ 0.53e-10■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EIF5B-203ENST00000470868 573 ntTSL 23.81□□□□□ -1.88e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-214ENST00000575329 3280 ntTSL 218.01■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-211ENST00000573523 3878 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PSMC5-219ENST00000584880 597 ntTSL 316.99■□□□□ 0.316e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PSMC5-204ENST00000579031 772 ntTSL 212.94□□□□□ -0.346e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-203ENST00000580070 1755 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.024e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-202ENST00000579039 2211 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-207ENST00000585132 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-201ENST00000578454 2307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.744e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.94e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NCOA4-205ENST00000583565 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.984e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 SNRNP200-207ENST00000493271 585 ntTSL 313.51□□□□□ -0.252e-15■■□□□ 12
G3BP1Q13283 FUS-209ENST00000566605 1787 ntTSL 1 (best)31.71■■■□□ 2.677e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.447e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.047e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.637e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 216.47■□□□□ 0.237e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 LRPPRC-205ENST00000447246 1209 ntTSL 1 (best)17.5■□□□□ 0.391e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 ANXA4-207ENST00000471395 4418 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.53e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 NOP2-215ENST00000542919 894 ntTSL 211.9□□□□□ -0.52e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 ACTN1-215ENST00000555616 919 ntTSL 311.84□□□□□ -0.512e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 GTF3C1-203ENST00000562609 2824 ntTSL 516.29■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 DCAF7-206ENST00000615512 751 ntTSL 519.03■□□□□ 0.643e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.172e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 WNK2-203ENST00000411624 6679 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-6■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 316.89■□□□□ 0.293e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 ALDOA-214ENST00000564688 613 ntTSL 514.31□□□□□ -0.121e-39■■□□□ 12
G3BP1Q13283 CNBP-210ENST00000512338 502 ntTSL 417.89■□□□□ 0.451e-9■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PHB2-210ENST00000544888 872 ntTSL 323.85■■□□□ 1.411e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PHB2-211ENST00000545167 908 ntTSL 522.49■■□□□ 1.191e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PHB2-204ENST00000536316 739 ntTSL 520.98■□□□□ 0.951e-7■■□□□ 12
G3BP1Q13283 EWSR1-215ENST00000469669 2630 ntTSL 219.35■□□□□ 0.691e-8■■□□□ 12
G3BP1Q13283 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 217.77■□□□□ 0.442e-9■■□□□ 12
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