Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCS1P62166 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms