Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SERPINC1P01008 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SERPINC1P01008 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms