Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LRP12Q9Y561 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LRP12Q9Y561 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms