Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDK12Q9NYV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDK12Q9NYV4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms