Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNTG1Q9NSN8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNTG1Q9NSN8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms