Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SMCO1Q147U7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMCO1Q147U7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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