Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNAQ00169 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms