Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD40LGP29965 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms