Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PSMB9P28065 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB9P28065 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.6 ms