Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
E2F6O75461 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
E2F6O75461 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
E2F6O75461 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms