Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.811e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 TBL1XR1-212ENST00000443315 580 ntTSL 43.75□□□□□ -1.816e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.811e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RGS12-219ENST00000511805 552 ntTSL 1 (best)3.55□□□□□ -1.841e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.851e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 R3HDM1-209ENST00000441871 556 ntTSL 43.33□□□□□ -1.881e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.931e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.951e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 ARHGAP12-206ENST00000454919 586 ntTSL 32.71□□□□□ -1.981e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.011e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RPS4Y1-204ENST00000515575 454 ntTSL 31.9□□□□□ -2.111e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 R3HDM1-205ENST00000425804 581 ntTSL 21.66□□□□□ -2.141e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 TBL1XR1-216ENST00000491623 582 ntTSL 51.53□□□□□ -2.166e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 LRCH3-209ENST00000452660 681 ntTSL 50.63□□□□□ -2.312e-11■■■■□ 23
RBFOX2O43251 TBL1XR1-229ENST00000636912 100 ntTSL 5-0.14□□□□□ -2.431e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 CDHR3-207ENST00000470188 2199 ntTSL 216.59■□□□□ 0.255e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 CDHR3-213ENST00000488386 540 ntTSL 34.42□□□□□ -1.75e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 211.22□□□□□ -0.614e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 ARHGAP4-224ENST00000494813 1939 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.298e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-211ENST00000477750 1062 ntTSL 215.8■□□□□ 0.123e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-206ENST00000432089 599 ntTSL 314.49□□□□□ -0.093e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-210ENST00000467451 743 ntTSL 213.99□□□□□ -0.178e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-209ENST00000466877 1080 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.198e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-207ENST00000460996 908 ntTSL 213.74□□□□□ -0.218e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-215ENST00000484950 873 ntTSL 212.37□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-212ENST00000477882 809 ntTSL 211.56□□□□□ -0.563e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-202ENST00000370011 538 ntTSL 511.04□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.648e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-204ENST00000393710 525 ntTSL 211.04□□□□□ -0.643e-8■■■■□ 23
RBFOX2O43251 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.848e-7■■■■□ 23
RBFOX2O43251 ZNF74-207ENST00000476678 3879 ntTSL 211.68□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.162e-17■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-208ENST00000465125 396 ntTSL 519.5■□□□□ 0.711e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.664e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-215ENST00000492766 367 ntTSL 310.69□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-214ENST00000488215 962 ntTSL 37.48□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-205ENST00000460659 454 ntTSL 27.15□□□□□ -1.261e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-216ENST00000592123 935 ntTSL 517.05■□□□□ 0.324e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-203ENST00000585989 568 ntTSL 414.7□□□□□ -0.064e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-208ENST00000590288 734 ntTSL 414.69□□□□□ -0.064e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-218ENST00000593103 562 ntTSL 514.58□□□□□ -0.084e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-212ENST00000591697 613 ntTSL 414.51□□□□□ -0.094e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-217ENST00000592378 533 ntTSL 414.2□□□□□ -0.144e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 RHBDF2-211ENST00000591255 545 ntTSL 412.81□□□□□ -0.364e-18■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-206ENST00000583741 1465 ntTSL 515.91■□□□□ 0.144e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.224e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-202ENST00000578430 689 ntTSL 210.92□□□□□ -0.664e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SRSF1-204ENST00000581979 1720 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.784e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-220ENST00000497359 1917 ntTSL 518.62■□□□□ 0.574e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-204ENST00000479115 2285 ntTSL 518.54■□□□□ 0.564e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-210ENST00000484673 1307 ntTSL 215.85■□□□□ 0.134e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-215ENST00000492329 2006 ntTSL 515.4■□□□□ 0.064e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 514.22□□□□□ -0.134e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-216ENST00000492370 1374 ntTSL 1 (best)13.96□□□□□ -0.184e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-218ENST00000494809 859 ntTSL 311.92□□□□□ -0.54e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.524e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-211ENST00000488350 4152 ntTSL 511.79□□□□□ -0.524e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 MST1-212ENST00000489007 737 ntTSL 311.17□□□□□ -0.624e-10■■■■□ 23
RBFOX2O43251 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.276e-12■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 MAPK12-209ENST00000497036 6248 ntTSL 215.85■□□□□ 0.137e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.357e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.457e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.736e-35■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-204ENST00000473486 714 ntTSL 218.85■□□□□ 0.611e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 318.3■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 518.3■□□□□ 0.521e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 216.69■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 WDR34-206ENST00000483181 801 ntTSL 210.42□□□□□ -0.741e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SLC25A10-208ENST00000574884 726 ntTSL 511.23□□□□□ -0.616e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 XPO6-209ENST00000566073 715 ntTSL 516.93■□□□□ 0.34e-10■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.398e-8■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.918e-8■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 PTPRS-202ENST00000353284 4518 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.792e-6■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.084e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.784e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-205ENST00000598159 747 ntTSL 317.57■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-209ENST00000601357 606 ntTSL 517.25■□□□□ 0.354e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-213ENST00000602088 622 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-204ENST00000597724 865 ntTSL 513.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-211ENST00000601614 628 ntTSL 211.49□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-214ENST00000607020 504 ntTSL 310.95□□□□□ -0.664e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.084e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 411.13□□□□□ -0.632e-7■■■■□ 22.9
RBFOX2O43251 ANKRD11-209ENST00000564553 471 ntTSL 310.91□□□□□ -0.662e-7■■■■□ 22.9
Retrieved 100 of 22,255 protein–RNA pairs in 220.1 ms