Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MED28Q9H204 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MED28Q9H204 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms