Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSBP4Q9BWG4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms