Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TRAPPC9Q96Q05 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC9Q96Q05 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms