Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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TRIM63Q969Q1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRIM63Q969Q1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRIM63Q969Q1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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