Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
WDR44Q5JSH3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
WDR44Q5JSH3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms