Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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BRD3Q15059 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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BRD3Q15059 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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BRD3Q15059 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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BRD3Q15059 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BRD3Q15059 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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