Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.55e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 EDC4-207ENST00000573992 3934 ntTSL 1 (best)13.38□□□□□ -0.275e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 CAP1-216ENST00000449311 681 ntTSL 521.22■□□□□ 0.993e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 517.94■□□□□ 0.463e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 516.08■□□□□ 0.163e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 BCOR-209ENST00000427012 1969 ntTSL 510.19□□□□□ -0.781e-6■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.759e-14■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.669e-14■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 HDAC5-211ENST00000592385 2601 ntTSL 518.4■□□□□ 0.549e-14■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.272e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 HDAC5-204ENST00000586802 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.39e-14■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 AKAP12-203ENST00000359755 6190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 210.62□□□□□ -0.712e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 SEC23B-208ENST00000494645 473 ntTSL 28.28□□□□□ -1.082e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 231.39■■■□□ 2.621e-6■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 HNRNPK-206ENST00000457156 1283 ntTSL 522.25■■□□□ 1.159e-8■■□□□ 12.4
G3BP1Q13283 TMEM214-207ENST00000444135 919 ntTSL 518.65■□□□□ 0.588e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CLTC-205ENST00000472651 665 ntTSL 26.33□□□□□ -1.41e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-205ENST00000528856 595 ntTSL 529.14■■■□□ 2.267e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.857e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.217e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-202ENST00000389645 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.087e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.877e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 DYNC1H1-210ENST00000556499 554 ntTSL 39.11□□□□□ -0.956e-9■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 ACTR3-206ENST00000484165 676 ntTSL 24.76□□□□□ -1.652e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.226e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.196e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.736e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.786e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-210ENST00000598325 1438 ntTSL 519.1■□□□□ 0.656e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.526e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PTOV1-218ENST00000601612 1480 ntTSL 216.67■□□□□ 0.266e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 AP2B1-218ENST00000619183 1595 ntTSL 514.04□□□□□ -0.166e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.372e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.162e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)18.24■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-213ENST00000599614 2447 ntTSL 517.89■□□□□ 0.452e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 HNRNPUL1-202ENST00000352456 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 POLR2A-202ENST00000573603 648 ntTSL 215.26■□□□□ 0.035e-8■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 SPTBN1-204ENST00000467371 3332 ntTSL 28.6□□□□□ -1.033e-15■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PCK1-202ENST00000467047 5074 ntTSL 1 (best)12.91□□□□□ -0.341e-14■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 PCK1-201ENST00000319441 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.351e-14■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 DSP-202ENST00000418664 7812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.25e-14■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.435e-14■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-227ENST00000534139 626 ntTSL 326.88■■□□□ 1.898e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-211ENST00000528314 559 ntTSL 226.6■■□□□ 1.858e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-217ENST00000530014 766 ntTSL 526.39■■□□□ 1.828e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-213ENST00000528377 898 ntTSL 225.72■■□□□ 1.718e-12■■□□□ 12.3
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G3BP1Q13283 NDUFV1-205ENST00000525086 575 ntTSL 423.58■■□□□ 1.378e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-218ENST00000530103 544 ntTSL 523.58■■□□□ 1.378e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-221ENST00000532244 786 ntTSL 222.7■■□□□ 1.228e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-219ENST00000530638 582 ntTSL 520.96■□□□□ 0.958e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-203ENST00000524838 1200 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.688e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-215ENST00000529867 582 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NDUFV1-224ENST00000532343 620 ntTSL 316.85■□□□□ 0.298e-12■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 ERBB3-220ENST00000552691 291 ntTSL 35.26□□□□□ -1.571e-21■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.267e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.027e-7■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NIPSNAP1-202ENST00000415100 661 ntTSL 527.87■■■□□ 2.053e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 NIPSNAP1-203ENST00000437094 674 ntTSL 315.13■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 MDH1-214ENST00000495083 552 ntTSL 25.55□□□□□ -1.523e-6■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-244ENST00000485673 715 ntTSL 534.65■■■■□ 3.148e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-228ENST00000469431 702 ntTSL 532.41■■■□□ 2.788e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-235ENST00000478585 543 ntTSL 232.41■■■□□ 2.788e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-257ENST00000604005 693 ntTSL 332.41■■■□□ 2.788e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.638e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.638e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.628e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-229ENST00000470512 913 ntTSL 531.16■■■□□ 2.588e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-237ENST00000480232 893 ntTSL 530.89■■■□□ 2.548e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-234ENST00000477931 1663 ntTSL 1 (best)29.27■■■□□ 2.288e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.18e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 524.51■■□□□ 1.518e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-226ENST00000467321 733 ntTSL 523.52■■□□□ 1.368e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 322.23■■□□□ 1.158e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-223ENST00000464788 583 ntTSL 219.9■□□□□ 0.788e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-249ENST00000490374 675 ntTSL 318.85■□□□□ 0.618e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-221ENST00000462499 492 ntTSL 217.36■□□□□ 0.378e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-241ENST00000482112 704 ntTSL 317.36■□□□□ 0.378e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.298e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-222ENST00000464624 3764 ntTSL 516.61■□□□□ 0.258e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-206ENST00000349036 581 ntTSL 516.06■□□□□ 0.168e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.028e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-239ENST00000481039 756 ntTSL 513.81□□□□□ -0.28e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-247ENST00000488546 897 ntTSL 513.67□□□□□ -0.228e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-216ENST00000419558 729 ntTSL 313.28□□□□□ -0.288e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-208ENST00000371075 2551 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.388e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-204ENST00000313949 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.478e-10■■□□□ 12.3
G3BP1Q13283 GNAS-218ENST00000450130 595 ntTSL 510.97□□□□□ -0.658e-10■■□□□ 12.3
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