RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470900.1

MANF-202, Transcript of mesencephalic astrocyte derived neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene MANF, Length 1,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANF-202ENST00000470900 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.54■■■■■ 7.28
MANF-202ENST00000470900 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.62■■■■■ 6.17
MANF-202ENST00000470900 ABCC9O60706 1549 aa51.87■■■■■ 5.89
MANF-202ENST00000470900 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.56■■■■■ 5.68
MANF-202ENST00000470900 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.32■■■■■ 5.65
MANF-202ENST00000470900 NACADO15069 1562 aa50.2■■■■■ 5.63
MANF-202ENST00000470900 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.14■■■■■ 5.62
MANF-202ENST00000470900 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.08■■■■■ 5.61
MANF-202ENST00000470900 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.04■■■■■ 5.6
MANF-202ENST00000470900 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.19■■■■■ 5.46
MANF-202ENST00000470900 SCRIBQ14160 1630 aa49■■■■■ 5.43
MANF-202ENST00000470900 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.65■■■■■ 5.38
MANF-202ENST00000470900 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.54■■■■■ 5.36
MANF-202ENST00000470900 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
MANF-202ENST00000470900 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
MANF-202ENST00000470900 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.13■■■■■ 5.13
MANF-202ENST00000470900 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.04■■■■■ 5.12
MANF-202ENST00000470900 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.97■■■■■ 5.11
MANF-202ENST00000470900 SMARCA4P51532 1647 aa46.9■■■■■ 5.1
MANF-202ENST00000470900 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.88■■■■■ 5.09
MANF-202ENST00000470900 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.71■■■■■ 5.07
MANF-202ENST00000470900 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.43■■■■■ 5.02
MANF-202ENST00000470900 SMARCA2P51531 1590 aa46.4■■■■■ 5.02
MANF-202ENST00000470900 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.38■■■■■ 5.02
MANF-202ENST00000470900 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.33■■■■■ 5.01
MANF-202ENST00000470900 WIZO95785 1651 aa46.29■■■■■ 5
MANF-202ENST00000470900 NCAPD3P42695 1498 aa46.28■■■■■ 5
MANF-202ENST00000470900 HMGXB3Q12766 1538 aa46.15■■■■■ 4.98
MANF-202ENST00000470900 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.09■■■■■ 4.97
MANF-202ENST00000470900 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.76■■■■■ 4.92
MANF-202ENST00000470900 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.63■■■■■ 4.9
MANF-202ENST00000470900 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.2■■■■■ 4.83
MANF-202ENST00000470900 NESP48681 1621 aa45.09■■■■■ 4.81
MANF-202ENST00000470900 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.02■■■■■ 4.8
MANF-202ENST00000470900 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.96■■■■■ 4.79
MANF-202ENST00000470900 CFTRP13569 1480 aa44.84■■■■■ 4.77
MANF-202ENST00000470900 PRDM2Q13029 1718 aa44.73■■■■■ 4.75
MANF-202ENST00000470900 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.65■■■■■ 4.74
MANF-202ENST00000470900 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.63■■■■■ 4.73
MANF-202ENST00000470900 ERCC6Q03468 1493 aa44.62■■■■■ 4.73
MANF-202ENST00000470900 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.49■■■■■ 4.71
MANF-202ENST00000470900 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.38■■■■■ 4.7
MANF-202ENST00000470900 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
MANF-202ENST00000470900 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.19■■■■■ 4.66
MANF-202ENST00000470900 WDR62O43379 1518 aa44.04■■■■■ 4.64
MANF-202ENST00000470900 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.04■■■■■ 4.64
MANF-202ENST00000470900 CUX2O14529 1486 aa43.9■■■■■ 4.62
MANF-202ENST00000470900 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.88■■■■■ 4.61
MANF-202ENST00000470900 TOPBP1Q92547 1522 aa43.86■■■■■ 4.61
MANF-202ENST00000470900 ABCC8Q09428 1581 aa43.83■■■■■ 4.61
MANF-202ENST00000470900 CUX1P39880 1505 aa43.78■■■■■ 4.6
MANF-202ENST00000470900 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
MANF-202ENST00000470900 SYNJ1O43426 1573 aa43.61■■■■■ 4.57
MANF-202ENST00000470900 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.59■■■■■ 4.57
MANF-202ENST00000470900 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
MANF-202ENST00000470900 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
MANF-202ENST00000470900 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.52■■■■■ 4.56
MANF-202ENST00000470900 IFT140Q96RY7 1462 aa43.4■■■■■ 4.54
MANF-202ENST00000470900 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
MANF-202ENST00000470900 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.34■■■■■ 4.53
MANF-202ENST00000470900 SOGA1O94964 1423 aa43.33■■■■■ 4.53
MANF-202ENST00000470900 WDR97A6NE52 1622 aa43.22■■■■■ 4.51
MANF-202ENST00000470900 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
MANF-202ENST00000470900 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
MANF-202ENST00000470900 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.09■■■■■ 4.49
MANF-202ENST00000470900 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
MANF-202ENST00000470900 TRIM41Q8WV44 630 aa43.02■■■■■ 4.48
MANF-202ENST00000470900 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.482e-9■■■■■ 36.3
MANF-202ENST00000470900 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.93■■■■■ 4.46
MANF-202ENST00000470900 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.92■■■■■ 4.46
MANF-202ENST00000470900 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.86■■■■■ 4.45
MANF-202ENST00000470900 PBRM1Q86U86 1689 aa42.86■■■■■ 4.45
MANF-202ENST00000470900 GRIN2BQ13224 1484 aa42.76■■■■■ 4.43
MANF-202ENST00000470900 KIF27Q86VH2 1401 aa42.68■■■■■ 4.42
MANF-202ENST00000470900 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.65■■■■■ 4.42
MANF-202ENST00000470900 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.6■■■■■ 4.41
MANF-202ENST00000470900 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.58■■■■■ 4.41
MANF-202ENST00000470900 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.57■■■■■ 4.41
MANF-202ENST00000470900 CHD1O14646 1710 aa42.52■■■■■ 4.4
MANF-202ENST00000470900 ADAMTS12P58397 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
MANF-202ENST00000470900 IGF1RP08069 1367 aa42.44■■■■■ 4.38
MANF-202ENST00000470900 SYNJ2O15056 1496 aa42.41■■■■■ 4.38
MANF-202ENST00000470900 CUL7Q14999 1698 aa42.38■■■■■ 4.37
MANF-202ENST00000470900 FBLN2P98095 1184 aa42.36■■■■■ 4.37
MANF-202ENST00000470900 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.36■■■■■ 4.37
MANF-202ENST00000470900 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.31■■■■■ 4.36
MANF-202ENST00000470900 EEA1Q15075 1411 aa42.24■■■■■ 4.35
MANF-202ENST00000470900 GRIN2AQ12879 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
MANF-202ENST00000470900 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.21■■■■■ 4.35
MANF-202ENST00000470900 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.19■■■■■ 4.34
MANF-202ENST00000470900 OSCARQ8IYS5 282 aa42.17■■■■■ 4.34
MANF-202ENST00000470900 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.12■■■■■ 4.33
MANF-202ENST00000470900 CEP170Q5SW79 1584 aa42.04■■■■■ 4.32
MANF-202ENST00000470900 PRXQ9BXM0 1461 aa42.04■■■■■ 4.32
MANF-202ENST00000470900 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.03■■■■■ 4.32
MANF-202ENST00000470900 NUP160Q12769 1436 aa41.99■■■■■ 4.31
MANF-202ENST00000470900 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.96■■■■■ 4.31
MANF-202ENST00000470900 KIF21BO75037 1637 aa41.86■■■■■ 4.29
MANF-202ENST00000470900 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.85■■■■■ 4.29
MANF-202ENST00000470900 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.75■■■■■ 4.27
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