Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.845e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.875e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.055e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.55e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.525e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.545e-7■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.635e-7■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.764e-6■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 SCD-201ENST00000370355 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.977e-7■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.337e-8■■■■□ 19.6
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ILF3Q12906 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 19.5
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ILF3Q12906 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.264e-10■■■■□ 19.5
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ILF3Q12906 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.933e-7■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 ARID1A-209ENST00000615191 3804 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 C3-208ENST00000596548 576 ntTSL 32.97□□□□□ -1.933e-10■■■■□ 19.5
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ILF3Q12906 AK4-203ENST00000470888 1043 ntTSL 223.71■■□□□ 1.391e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.821e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-204ENST00000474968 928 ntTSL 214.58□□□□□ -0.081e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.521e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 AK4-205ENST00000479060 867 ntTSL 39.24□□□□□ -0.931e-8■■■■□ 19.5
ILF3Q12906 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.584e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 LDHA-215ENST00000537296 1511 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 LDHA-210ENST00000486690 664 ntTSL 57.27□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.771e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.65e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MRPL45P2-204ENST00000575291 1765 ntTSL 1 (best)7.66□□□□□ -1.185e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MRPL45P2-202ENST00000572695 804 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.631e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.353e-6■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARHGEF10L-206ENST00000469726 4585 ntTSL 212.89□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARHGEF10L-201ENST00000167825 3018 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARHGEF10L-203ENST00000375408 3685 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.62e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 ARHGEF10L-204ENST00000375415 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 19.4
ILF3Q12906 BUB1-201ENST00000302759 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.942e-10■■■■□ 19.4
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